A capela insere-se no conjunto do Centro de Reabilitação de Alcoitão, criado em 1956 pelo Provedor da Santa Casa da Misericórdia de Lisboa, Dr. José Guilherme de Mello e Castro. O projeto de arquitetura é da autoria do arquitecto Sebastião Formosinho Sanches, e a direção da obra da responsabilidade do engenheiro José Maria Ferreira da Cunha.
No dia 10 de Fevereiro de 2013, a capela foi dedicada a São Roque, sendo benzida a imagem do orago oferecida pela Irmandade de Misericórdia e de S. Roque.