Na antiga freguesia de Belém, erguia-se no lugar do Tojal, a antiga igreja paroquial de Benfica, a poente e norte do actual templo. Uma das primeiras referências data de 1391, referindo-se á atribuição do direito de padroado sobre a Paróquia, em favor da Paróquia do Santíssimo Salvador, da cidade. Em 1586, foi instituída canonicamente a Irmandade de Nossa Senhora do Amparo.
O Pe. Álvaro Proença na obra Benfica através dos tempos (Lisboa 1964) afirma que a capela gótica de S. Roque estava incorporada nesta igreja e, sendo esta a primitiva igreja paroquial de Benfica. Mas, até ao momento, são escassos os elementos históricos que existem acerca desta capela de São Roque.
Foi edificada uma nova igreja paroquial sobre a Real Estrada de Benfica, à qual estava ligada pela Azinhaga que do Tojal, mas este templo foi gradualmente abandonado, com a inauguração de uma nova igreja, em 1809.