Instituída em 1506, a Confraria de São Roque recebe, por doação perpétua e irrevogável do Mosteiro de São Domingos da cidade de Lisboa, uma terra e herdade para edificar «a Igreja com sua alpendorada e dedicada ao Bemaventurado São Roque». Nesse primeiro tempo surge o nome de um Oficial da Mesa com funções de mordomo - Ant.º [dslz’] Fereire -, morador na Rua Nova d’el Rei.
Um século mais tarde, e já possuindo uma nova área de culto - a Capela de São Roque -, com a sua Sacristia/Casa do Despacho, na Igreja de São Roque da Companhia de Jesus, a Irmandade firma em Compromisso de 1605, com as normas e funções da sua missão, regulando o códigos de conduta dos 72 irmãos e oficiais, cujo perfil deveria ser de «pessoas honradas, virtuosas e abastadas que possam servir, favorecer e ajudar».
O ato eleitoral para eleger os órgãos da Mesa realizava-se no espaço da Capela de São Roque, no segundo Domingo de Janeiro (após o dia de São João Evangelista, a 27 de Dezembro). O nome dos Irmãos e Confrades fazia parte de um rol que era entregue ao Andador, o qual convocava por «recado dado» a cada elemento para se apresentarem na Sacristia da Capela de São Roque. No dia da votação, os Irmãos tinham de chegar antes das duas horas da tarde à Capela para assim se dar inicio à cerimónia eleitoral. O local de oração era simultaneamente o cenário modelo para um compromisso de vida e de dedicação, cada irmão era convocado para em comunidade passar a realizar gestos de caridade: de dar e de receber. Para assumir esse enlaço vinculativo, a Capela era o local sagrado de testemunho e na qual era colocada a mesa da confraria, onde se procederia à formalização dos atos oficiais, com o auxílio do livro de Compromisso e o Livro de Assentos dos Irmãos.
A cerimónia iniciava-se com a leitura do capítulo segundo do Compromisso, referente à “Eleição dos Irmãos”. Terminada a leitura, os Oficiais retiravam-se da Capela ficando apenas o Provedor e o Escrivão. Depois, aproximavam-se um a um e nomeavam cinco nomes, para os sete cargos de Provedor, Escrivão, Arrecadador das Esmolas, Procurador e três Mordomos da Capela. O ato era finalizado com o juramento dos eleitos que colocam a mão sobre o Compromisso. O mandato era anual.
Os oficiais da Mesa tinham funções específicas na orgânica da instituição, e deviam pugnar pelo cumprimento escrupuloso das cláusulas consignadas no Compromisso, designadamente: Venerar a Relíquia; Honrar todos os Irmãos e serem presentes na Igreja e Capela do Santo para participarem nas celebrações do Dia do Santo (16 de Agosto); participar nas Celebrações do Dia de São Sebastião (20 de Janeiro); comungar no Dia da Festa de São Roque ou na Véspera (se estivesse envolvido na organização da festa); realizar as Vésperas Solenes com Missa Cantada; organizar a Festa do Santo com Missa Cantada, Pregação e Veneração à Relíquia de São Roque.
Se o irmão tivesse algum impedimento e não cumprisse com a sua obrigação, eram novamente chamados os irmãos eleitores e juntos, elegiam um outro irmão.
Em 1727, a eleição realizou-se a 31 de Agosto, por voto dos «eleitores que se assentou fossem os irmãos mais antigos que tem a irmandade athe seis, e assim corresse a roda anualmente por toda a Irmandade pera todos por sua antiguidade se empregassem no serviço do Glorioso Santo» (AH/IMSRL Doc. 14, cx 2). Aos Irmãos da Mesa também competia contribuir «com o maduro de meia moeda de ouro» para financiar as celebrações em honra de São Roque.
No ano de 1756, e na sequência do Terramoto que destruiu Lisboa no ano anterior, não se realizou a eleição e os Oficiais de Mesa com os cargos mais relevantes (Tesoureiro e Escrivão) mantêm-se em funções nos anos seguintes. O livro de Assentos de Termo de Posse só é novamente preenchido no ano de 1762.
A Reforma dos Estatutos da Irmandade de São Roque ocorrerá na sequência da instauração da República, em sessão de Junta Grande da Irmandade, a 24 de Dezembro de 1911, com a aprovação do Governo Civil de Lisboa, em 26 de Junho de 1913. A Irmandade manteve o espírito cultual, mas a Mesa passou a ser constituída por sete elementos.
A nova aprovação dos Estatutos da Irmandade realiza-se na Assembleia-Geral de 9 de Dezembro 1934, com aprovação pelo Governo Civil de Lisboa a 18 de Julho de 1935.
Segue-se a alteração aos Estatutos no ano de 1960 e em 1978, os novos Estatutos substituem o documento de 1934.
Em 1990, são aprovados os novos estatutos da Irmandade da Misericórdia e de São Roque de Lisboa.
A fusão da Irmandade da Misericórdia de Lisboa (1498) permitiu transformar a Irmandade de São Roque (meramente cultual) na atual Irmandade da Misericórdia e de São Roque.
De 2006 a 2010 são aprovadas sucessivas alterações aos Estatutos.
Em 2011, a Assembleia-Geral aprova um novo Compromisso e Estatutos da Irmandade da Misericórdia e de São Roque de Lisboa. Estes estatutos marcam a fusão da Irmandade da Misericórdia (1498) e da Irmandade do Glorioso São Roque dos Carpinteiros de Machado (1581) na Irmandade da Misericórdia e de São Roque.
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Primeiro Irmão Vice-Provedor
Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho
Segundo Irmão Vice-Provedor
António Balcão Reis
Mesários
José Tomaz Ferreira, Maria Luísa Guterres Barbosa Colen, Elizabeth Teixeira Antunes Teixeira, Manuel Tomás Mateus da Silva Garcia, Custódio Joaquim Braz, Luís Manuel Mendes da Silva Pires de Oliveira, OFM, António Pais Agostinho Homem, Martinha Maria Mendes Soeiro Tomaz
Mesários Suplentes
Carlos Alberto Restani Graça Alves Moreira, Ana Paula Matos Barros
(De 21-02-2011 até à Assembleia Geral de 15-07-2013)
Irmão-Provedor
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Primeiro Irmão Vice-Provedor
Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho
Segundo Irmão Vice-Provedor
António Balcão Reis
Mesários
José Tomaz Ferreira, Maria Luísa Guterres Barbosa Colen, Elizabeth Teixeira Antunes Teixeira, Manuel Tomás Mateus da Silva Garcia, Custódio Joaquim Braz, Luís Manuel Mendes da Silva Pires de Oliveira, OFM, António Pais Agostinho Homem, Gonçalo Rodrigues Cadete
Mesários Suplentes
Rui Pedro Mesquita Ventura, Martinha Maria Mendes Soeiro Tomaz
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Irmão Vice-Provedor
Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho
Mesários
Ana Campos Reis Martinho Lopes, Francisco D’Orey Manoel, José Tomaz Ferreira, Mário Rui Domingues Lopes André, Maria Luísa Guterres Barbosa Colen, José da Mata de Sousa Mendes, Elizabeth Teixeira Antunes Teixeira, Manuel Tomás Mateus da Silva Garcia, Custódio Joaquim Braz
Mesários Suplentes
Luís Manuel Mendes da Silva Pires de Oliveira, OFM, António Pais Agostinho Homem
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Irmão Vice-Provedor
Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho
Mesários
Ana Campos Reis Martinho Lopes, Ana Mafalda Roquette de Quadros Ferro, Francisco D’Orey Manoel, José Tomaz Ferreira, Mário Rui Domingues Lopes André, Maria Luísa Guterres Barbosa Colen, Maria Irene Costa David
Mesários Suplentes
José da Mata de Sousa Mendes, Maria Carlota de Bragança Pereira da Silva Mantero
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Irmão Vice-Provedor
Manuel Inácio Antunes Pinto
Mesários
Ana Campos Reis Martinho Lopes, Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho, Luís Manuel Baptista da Silva Moreira, Francisco D’Orey Manoel, José Tomaz Ferreira, Mário Rui Domingues Lopes André, Maria Catarina Palma Fialho, Ana Mafalda Roquette de Quadros Ferro
Mesários Suplentes
Maria Luísa Guterres Barbosa Colen, Maria Irene Costa David
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Irmão Vice-Provedor
Manuel Inácio Antunes Pinto
Mesários
Ana Campos Reis Martinho Lopes, Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho, Luís Manuel Baptista da Silva Moreira, Francisco D’Orey Manoel, José Tomaz Ferreira, Mário Rui Domingues Lopes André, Maria Catarina Palma Fialho
Mesários Suplentes
Ana Mafalda Roquette de Quadros Ferro, Álvaro Joaquim Fernandes
Pedro António José Bracourt Pestana de Vasconcelos
Irmão Vice-Provedor
Manuel Inácio Antunes Pinto
Mesários
Ana Campos Reis Martinho Lopes, Mário do Nascimento Vieira Pinto Coelho, Luís Manuel Baptista da Silva Moreira, Francisco D’Orey Manoel, José Tomaz Ferreira, Mário Rui Domingues Lopes André, Gaspar da Mota Gaspar
Mesários Suplentes
Maria Catarina Palma Fialho, Álvaro Joaquim Fernandes
Fernando José da Silveira, Francisco Pedro Gonçalves Lobato, Antonio Joaquim de Mattos
Mordomos
Joaquim dos Santos Pereira, Prior João Carlos d’Andrade, Pe. José de Santo Antonio Silva, Custodio Maria da Costa Moraes, Jacob Francisco de Paulo Fernandes, Manoel Sérgio Victoria Pereira, Nicolao Lagalerb, Antonio Rebello de Mendonça, Joaquim José Pereira, José Ezequiel da Costa Ricci, Antonio Maria da Costa e Sá, José Paes Gago
Mordomos da Capela
Cypriano Manoel da Silva Moraes, Vicente Antonio da Silva Correa, Marquês de Viana, Conde Barão do Alvito, Conde de Pombeiro, Marquês de Torres Novas, Conde Redondo, Conde de Penamacor
Marquês de Viana, Conde do Redondo, Conde de Pombeiro, Antonio da Silva Albuquerque Castro Ribafria, Florido Rodrigues Pereira Ferraz, Vicente Antonio da Silva Ferreira
Mordomos da Capela
João Jordani, Cypriano Manuel da Silva Moraes, Custodio Maria da Costa Moraes, Caetano Jordani
Conde de Castelo Melhor, Dez.or Gonçalo Jozeph da Silveira Preto, Caetano Botelho de Gouvea, Dez.or João Marques Bacalhau, Mateus Francisco Padrão, Christovão da Rocha Cardozo
Mordomos da Capela
Fernando Xavier de Miranda Henriques, Custódio Ferreira Goes, Dr. Jose Maria de Lancastre, Rafael da Silveira Braga
Pe. Mateus Pereyra, Antonio Pedro de Vasconcellos, Francisco Antonio Soares da Silva, Matias Fernandes, Rafael de Oliveira Braga, Luis da Fonseca Claro
Francisco Pedro de Abreu, Jozeph Bisso, Domingos Pires Bandão, Antonio Joaquim de Oliveira, João Evangelista, Pe. Domingos Maria Vaccari, André Ferreira da Silva, Rodrigo Xavier Alz. de Moura
Pe. Francisco Pereira de Castro, Manoel Fernandes Calheiros, Francisco Correa da Silva, Caetano Botelho de Gouvea
Consultores
Pe. António Pontuas, Antonio Secundo Freire de Brito, Manoel de Faria Monteiro, Antonio Froes de Azevedo, Jozeph de Almeida Alvarez, Antonio Soares de Carvalho
Felipe Neri, Pe. Luís de Moraes, Luis da Fonseca Claro
Consultores
Conde de Castelo Melhor, D. Miguel Maldonado, Joseph Antonio de Almeida, António Roiz. Maia, Gaspar de Castro Calheiros, Francisco Xavier Soares, Pe. Joachim Ribeiro de Carvalho, Francisco António Soares da Silva
Pe. Francisco Pedro Abreu, Pe. Jozeph Bisso, Bartolomeu de Souza Mexia
Consultores
Pedro de Roxas de Azevedo (Conselheiro da Fazenda), Sebastiam Xavier da Gama Lobo, Francisco de Seixas de Vasconcelos, Diogo Alberto Tinoco, Caetano Botelho de Gouveia, Antonio Pedro de Vasconcelos, António Froes de Azevedo
João Latino Soares, Pe. Jozeph Caldeira, Jozeph de Almeida
Consultores
Dez.or Francisco Nunes Cardial, Dez.or Jozeph Vaz de Carvalho, João de Souza Mexia, Dez.or Paulo Jozeph de Andrada, Pe. Felipe Neri, Manoel de Vasconcellos
A 27 de Agosto de 1730, D. João V constitui-se Provedor Perpétuo da Irmandade de São Roque. Livro dos Provedores Perpétuos da Irmandade de São Roque, 1732-1973, IMSRL cx 1-D, Doc. 38
António Mendes Pimentel (Tesoureiro Geral do Tabaco), António de Abreu e Sousa de Carvalho (Professo na Ordem de Cristo), João Latino Soares (Homem de Negócios)