Altar da Capela de São Roque com a pintura de São Roque, da autoria de José da Costa Negreiros (1714-1759), meados do século XVIII, óleo sobre telaO Arsenal é construído e lá dentro é ereta a Capela de São Roque, que apresenta características únicas: com 9,25 metros de comprimento, 6,40 metros de largura e15,30 metros de altura. O espaço da nave é marcado pela forte verticalidade, lançada de forma a induzir a admiração no observador, auxiliada pela luz que penetra através da fenestração lateral e da configuração do teto, que se apresenta em abóbada truncada. A decoração enuncia um espírito de transição do rocaille é é realizada por João Grossi (em 1769), que também é o autor dos estuques da Casa para as Audiencias do Ouvidor da Alfandega.
A capela tem duas portas laterais, uma de acesso ao púlpito (esquerda) e outra à sacristia (direita), destaca-se o janelão gradeado, ao nível do andar nobre e com acesso à Casa de Despacho da Irmandade, cuja obra é realizada em 1861/863, por João Eloi de Mendonça, que também realiza a empreitada de abertura da serventia do coro pela sacristia e alargamento da tribuna na Casa de Despacho.