A realização do “Compromisso da Irmandade Benaventurado São Roque em a Igreja da Companhia de Jesus Ordenado pelos Irmãos desta Antiga Confraria em Lisboa o Año de M.D.C.V.”, marca um novo período de vida da instituição após o acordo celebrado com a Companhia de Jesus. A realização deste instrumento regulamentar é fundamentado pela necessidade de estimular os princípios e fervor devocional ao Santo, como manifestação dos princípios originários por parte dos confrades. O Compromisso particulariza e rege as funções e códigos de conduta dos 72 irmãos, que devem ser “pessoas honradas, virtuosas e abastadas que possam servir, favorecer e ajudar”, prestando o auxílio e assistência tanto espiritual e material aos Oficiais, Irmãos, familiares e benfeitores defuntos. As obrigações instituídas pela autoridade do Compromisso dão sentido às acções conjuntas de vida espiritual de Venerar a Relíquia; honrar todos os Irmãos e serem presentes na Igreja e Capela do Santo; participar nas celebrações do Dia do Santo (16 de Agosto); participar nas Celebrações do Dia de São Sebastião (20 de Janeiro); comungar no Dia da Festa de São Roque ou na Véspera (se estivesse envolvido na organização da Festa); realizar as Vésperas Solenes com Missa Cantada; organizar a Festa do Santo com Missa Cantada, Pregação e Veneração à Relíquia de São Roque.
Nesse ano, são colocadas as “Pedras dos luguares sanctos de Hyexusalle q[ue] Trouxe Inacio de Lima. E os deu a Confraria do Bem auenturado S. Roque – e se meterã neste Rellicario sendo elle Juiz da confraria año de 1605”, como se afirma no texto redigido num fragmento de papel, que se encontra dentro do Relicário de São Roque, executado em madeira prateada, encomenda que é feita no século XIX.